A reflux betegség szövődménye (másik neve Barrett-szindróma), tíz-tizenöt év után alakul ki a reflux-betegek kb. 10 százalékánál. Szinte tünetmentes, de növeli a mirigyes nyelőcsődaganat kialakulásának esélyét. A nyelőcső felületi szövetei a legalsó, gyomorszájhoz közel eső szakaszon  vagy a nyelőcső több cm-nyi részén elváltoznak. A sejtek átalakulnak, megvastagszanak, a bélrendszer belső falának sejtjeire hasonlítanak, hogy jobban tudjanak védekezni a maró gyomornedvek ellen. Ha az átalakult sejtek burjánzani kezdenek, abnormális növekedésükkel daganatot okozhatnak. Rendszeres orvosi kontroll javasolt.